根据省委、省政府批准的《東營市人民政府机构改革方案》(魯委〔2000〕273號)和《中共東營市委、東營市人民政府關于東營市人民政府机构改革實施意見》(東發〔2001〕7號)，東營市海洋与水產局更名為東營市海洋与漁業局。市海洋与漁業局是主管全市海洋事務和漁業行政的市政府工作部門。
　　一、職能調整
　　(一)增加的職能
　　1、承辦“海上東營”建設領導小組辦公室的日常工作。
　　2、負責水生野生動物的保護和防疫工作，參与漁用藥物和飼料的監督管理。
　　(二)轉變的職能
　　加強全市海域使用管理和海洋環境保護，确保海洋資源可持續利用和海洋經濟快速、健康發展。將漁業技術推廣等技術性、服務性工作交給有關事業單位、協會承擔。
　　二、主要職責
　　結合以上職能調整，市海洋与漁業局的主要職責是：
　　(一)貫徹執行國家、省有關海洋与漁業的法律法規和方針政策，研究擬定全市海洋与漁業的政策措施并監督實施。
　　(二)編制并組織實施全市海洋開發和漁業發展規划、計划和海洋功能區划、海域使用規划。
　　(三)監督管理海岸帶、內海等管轄海域的使用，負責海域使用許可制度和海域有償使用制度的實施与監督，協調各涉海部門、行業的海洋開發活動，承擔組織全市海域勘界，會同有關部門審核報批近岸海域范圍內的海底電纜鋪設、管道路由、海上人工构造物設置和重大涉海工程項目。
　　(四)負責海洋和漁業水域生態環境保護工作。組織擬定全市海洋与漁業環境保護与整治規划，組織調查處理漁業水域污染事故，貫徹執行污染物排海總量控制制度，按照國家標准監督陸源污染物排放入海，防止海洋石油勘探開發、海洋傾廢、海洋工程建設項目造成的污染損害，組織海洋環境的調查、監測、監視、評价和科學研究，監督海洋生物多樣性和水生野生動物保護，選划和監督管理海洋自然保護區和特別保護區，核准新建、改建、擴建海岸和海洋工程項目的環境影響報告書。
　　(五)組織海洋与漁業經濟、資源、環境調查。指導海洋防災減災工作，發布漁情預報，海洋預報和海洋環境預報，管理海洋觀測、監測、災害預報警報等公益服務系統。
　　(六)負責全市漁業產業結构与布局調整、水產种質資源管理和原(良)种場的報批，組織、協調、指導水產增養殖業、海洋捕撈業及養殖生態環境的調控。指導水產品加工、流通。根据國家授權擬定漁船、漁机、网具制造規范和技術標准并監督實施。
　　(七)負責漁政管理、漁港監督和漁船檢驗工作。管理保護漁業資源，監督實施漁業捕撈許可制度和休漁期制度，維護漁業生產秩序，負責漁業搶險救助和漁業無線電通信管理工作。
　　(八)負責水生野生動物的防疫和水產養殖病害防治工作，參与漁用藥物和飼料的監督管理。
　　(九)管理全市海監和漁業執法隊伍，依法在全市漁港和管轄水域實施巡查監視，監督管理，查處違法活動，維護國家海洋与漁業權益。
　　(十)會同有關部門編制全市海洋与漁業科技發展規划、計划，組織重大科研項目的攻關及成果應用推廣，組織、指導海洋与漁業人才培養、教育工作。
　　(十一)負責海洋与漁業對外經濟技術交流和合作，監督執行國際漁業公約和雙邊、多邊漁業協定，協調處理海洋与漁業涉外事件。
　　(十二)負責海洋与漁業的基本建設、統計、財務、信息、資料、宣傳和檔案管理工作，負責海洋与漁業行政應訴、行政复議和行政執法監督檢查。
　　(十三)承辦“海上東營”建設領導小組辦公室的日常工作。
　　(十四)負責本部門及部門職責范圍內的安全工作。
　　(十五)承辦市委、市政府交辦的其他事項。
　　三、內設机构
　　根据以上職責，市海洋与漁業局設4個科室。
　　(一)辦公室(挂政策法規科牌子)
　　協助局領導組織協調机關日常工作，負責机關文秘、信息、檔案、保密、信訪、督查、宣傳、會務、接待、后勤和安全工作。研究提出海洋与漁業發展戰略和政策措施，擬定海洋与漁業法制建設規划，組織協調海洋与漁業工作調研，負責海洋与漁業行政應訴、行政复議和行政執法監督檢查，負責局机關和直屬單位的人事、勞動工資和社會保障及离退休人員的服務工作，組織﹛@傅急鞠低車慕逃�皸I島托幸導寄薌�唌@テ鰲３邪�“海上東營”建設領導小組辦公室的具体工作。
　　(二)計划財務科
　　研究擬定海洋与漁業中長期發展規划和年度計划，組織擬定海洋与漁業科技發展規划与計划，負責海洋与漁業基本建設、技改項目的論証、報批，負責海洋与漁業重大科技項目的論証、申報，負責海洋与漁業統計工作，編制海洋与漁業事業費預算并處監督執行，負責局机關財務管理，指導、監督直屬單位財務、國有資產管理。
　　(三)海域管理科(挂環境保護科牌子)
　　組織編制全市海洋功能區划和海域使用規划，組織實施海域使用許可制度和海域有償使用制度，組織海洋、海岸工程的海域使用可行性論証，負責近岸海域和灘涂采砂用海的海域使用可行性論証和管理，會同有部門審核報批近岸海域海域海底電纜鋪設、管道路由和海上人工构造物設置，組織開發海洋、海岸帶資源調查，組織指導全市海域勘界，負責海岸線以下海域和海岸線以上与潮間帶相連的用于海水養殖的荒灘的管理。組織指導全市海洋与漁業水域環境保護工作，擬定全市海洋与漁業水域環境保護与治理規划，貫徹執行污染物排海總量控制制度，防止海洋石油勘探開發、海洋傾廢、海洋工程建設項目造成的污染損害，選划和管理海洋自然保護區和海洋特別保護區，組織海洋環境調查和評价，組織調查處理漁業水域污染事故，組織審核海岸工程項目和核准海洋工程項目的海洋環境影響報告書，負責海洋減災防災工作，管理海洋公益服務系統。
　　(四)漁業科(挂經濟貿易科牌子)
　　指導、協調全市漁業生產，負責水生野生動物的防疫和水產養殖病害防治，擬定并指導實施水產養殖、增殖計划，負責漁業原(良)种場建設以及水產苗种的引進、生產的審批和質量監督管理，負責全市漁業示范基地建設，組織漁業經濟調查，發布漁情預報，負責近海和外海漁汛期捕撈生產的調度和漁具漁法改良指導工作，負責海洋与漁業對外經濟技術交流和合作，負責遠洋漁業開發管理，監督執行國際漁業公約和雙邊、多邊漁業協定，負責海洋漁業外經項目的管理。指導全市水產品加工、流通和進出口貿易，根据國家授權擬定漁船、漁机、网具制造規范和其他漁業技術標准并監督實施，會同有關部門辦理漁用藥物和飼料的審批，指導全市水產品批發市場建設。
　　四、人員編制
　　市海洋与漁業局机關編制總額16名，其中，行政編制13名，离退休干部工作人員編制1名，工勤人員編制2名。可配備局長1名，副局長3名，科級領導職數4名。紀檢、監察机构和人員編制按這次机构改革的有關規定執行。
　　五、其他事項
　　(一)海洋与漁業部門管理海岸線以下海域和海岸線以上与潮間帶相連的用于海水養殖的荒灘，其他荒灘由國土資源部門管理。
　　(二)市海洋与漁業局負責全市海洋環境的監督、管理，組織海洋環境的調查、監測、監視、評价和科學研究，負責全市防治海洋工程建設項目和海洋傾倒廢棄物對海洋污染損害的環境保護工作。市環境保護部門對全市海洋環境保護實施指導、協調和監督。